转化率99.5%!天津工生所从0到1重构"甲醇→丙烯酸"无细胞酶级联通路

丙烯酸(Acrylic Acid), 这个名字或许不够"出圈",但它的下游产品几乎包围了我们的日常生活:婴儿纸尿裤中的高吸水性树脂(SAP)、建筑涂料、胶粘剂、纺织品整理剂……2025年全球丙烯酸市场需求已逼近900万吨,预计2030年将突破1041万吨,市场规模超过96亿美元。
然而,如此庞大的产业至今仍几乎完全绑定在化石基原料之上。工业上,丙烯酸主要通过丙烯(石油衍生品)的两步催化氧化法生产——不仅依赖不可再生资源,还伴随高能耗、大量CO₂排放以及有毒副产物(如丙烯醛)的生成。
生物合成路线理论上更绿色,但现实十分骨感。此前报道的5条微生物合成路径(甘油途径、丙二酰-CoA途径、β-丙氨酸途径等)普遍面临三大死结:路径冗长(需要3-5步酶促反应)、辅因子依赖严重(如昂贵的维生素B12)、以及最致命的——丙烯酸本身对微生物细胞具有极强的毒性。这导致现有活体细胞(in vivo)路线的产量长期卡在毫克级别,转化率甚至低于3%。
与其在活细胞里"戴着镣铐跳舞",不如跳出碳基生命的限制,从底层酶催化机制出发,打造一条全新的体外无细胞(Cell-free)生物合成路线。

[SynBioCon] 获悉,7月21日,中国科学院天津工业生物技术研究所江会锋研究员、刘玉万研究员和盛翔研究员团队联合中国科学技术大学等机构在《自然·通讯》发表了题为“Towards an enzyme cascade synthesis of the bulk chemical acrylic acid”的研究论文,他们通过挖掘和改造ThDP依赖酶并结合体外多酶级联路径,将甲醇转化为丙烯酸,产量达到4.3克/升,转化率高达99.5%。

01
团队与核心策略:为什么是ThDP依赖酶?
江会锋团队长期深耕新酶设计与一碳生物合成领域,此前已在乙酰辅酶A的一碳合成途径设计方面取得重要突破。这一次,他们将目光投向了一个更"大胆"的目标——让酶催化一个自然界中不存在的反应。
有机化学中,H₂PO₄⁻是一个良好的离去基团,可以在特定条件下发生消除反应生成双键。受此启发,团队提出了一个极为精巧的设计思路:
能否找到一种酶,催化磷酸二羟丙酮(DHAP)直接消除H₂PO₄⁻,一步生成丙烯酸?
他们锁定了一类名为硫胺素二磷酸(ThDP)依赖性酶的蛋白家族。ThDP酶在自然界中擅长催化C-C键的形成与断裂,但从未被报道过能够催化磷酸消除反应。通过虚拟筛选,团队找到了一个活性最高的候选酶——ProThDP2,由此开启了"从0到1"的酶催化功能重塑之旅。

02
催化机制揭秘:四步"分子舞蹈"与22.9 kcal/mol的限速步骤
为了理解ProThDP2如何实现这一非天然反应,团队利用密度泛函理论(DFT)量子化学计算,对完整催化循环进行了原子级别的解析。
整个反应被拆解为四步精密的"分子舞蹈":
第一步:异构化。DHAP在酶活性中心发生构型重排,转化为D-甘油醛-3-磷酸(D-G3P),为后续ThDP亲核进攻做好准备。
第二步:烯醇-ThDP中间体形成。ThDP的叶立德(ylide)形式进攻D-G3P的醛基碳,经过两次关键的质子转移——H120和E57被确认为介导这两次质子转移的核心氨基酸残基——生成稳定的烯醇-ThDP共价中间体(Int7)。
第三步:H₂PO₄⁻消除(限速步)。在烯醇-ThDP构象下,C-O键发生断裂,H₂PO₄⁻作为离去基团被直接消除,生成丙烯酰-ThDP。DFT计算表明,这一步C-C键断裂的能垒为22.9 kcal/mol(对应过渡态TS10),是整个催化循环的限速步骤。
第四步:水解。丙烯酰-ThDP水解释放丙烯酸,酶恢复初始状态,进入下一轮催化循环。
这一机制的阐明,相当于为后续的理性改造提供了一张精确到每个氨基酸残基的"分子地图"。
03
定向进化的"新武器":ADE-OPI-MS全自动高通量筛选
天然ProThDP2的催化效率远不能满足工业级应用。团队祭出了合成生物学领域的一项前沿装备——基于声波液滴喷射-开放端口接口质谱(ADE-OPI-MS)的全自动高通量筛选平台。
传统的酶定向进化受限于人工操作,通量低、周期长。而该自动化平台将"构建-测试-学习"的循环速度提升了一个数量级。经过多轮深度改造,团队从庞大的突变体库中筛选出超级突变体ProThDP2-M4,并正式将其命名为丙烯酸合酶(Acrylic Acid Synthase, AAS)。
AAS的k_cat/K_m值比野生型高了13.6倍,结构分析显示D424R、P8C和G176R这三个远端突变通过引入新的盐桥和氢键让蛋白的熔解温度提升了12摄氏度,T492G突变可能减小了底物进出通道的空间位阻。

有了核心催化剂AAS,团队搭建了完整的甲醇制丙烯酸(MAAP)体外多酶级联途径,分为两个模块:
模块一:甲醇 → 二羟基丙酮(DHA)
● 醇氧化酶(AOX)将甲醇氧化为甲醛,同时由过氧化氢酶(CAT)解毒副产物H₂O₂
● 工程化甲醛裂合酶(FLS-M3)将甲醛缩合为二羟基丙酮(DHA)
模块二:DHA → 丙烯酸(AA)
● 多聚磷酸激酶(PPK)实现ATP的高效再生(以廉价的多聚磷酸钠为底物)
● 二羟基丙酮激酶(DAK)利用ATP将DHA磷酸化为DHAP
● 核心人工酶AAS催化DHAP直接消除H₂PO₄⁻,生成丙烯酸
在工艺优化中,团队发现了一个关键瓶颈:丙烯酸自身的酸性会随反应进行导致pH下降,严重抑制AAS活性。通过引入KOH精准调控pH值,成功打通了这一障碍:
16小时的单锅分步反应中,180 mM甲醇被高效转化,丙烯酸滴度高达4.3 g/L,转化率达到惊人的99.5%,生产强度达268.9 mg/L/h(比已知文献报道高出34-448倍)!
04
成本分析与前景
从实验室到工厂,成本是绕不开的话题。文章表示:
● 原料成本优势: 采用“绿色甲醇”作为碳源(当前成本约200-400 USD/吨)。按文章测算,生产1吨丙烯酸仅需约1.34吨甲醇,碳源成本仅为268美元/吨,极具成本竞争力。
● 绕开毒性瓶颈,突破产能天花板: 传统微生物发酵(in vivo)极难克服丙烯酸的细胞毒性,产量极具上限。本项目采用无细胞生物制造(Cell-free Biomanufacturing)体系,完美规避了宿主毒性问题,是剧毒化学品生物合成的教科书级解决方案。
● 综合成本模型: 结合廉价甲醇、多聚磷酸钠主导的ATP再生(约1050 USD/吨)、产物分离(约55 USD/吨),在未来高密度发酵量产酶及固定化酶技术的加持下,总体生产成本有望控制在1600 USD/吨以下,完全有实力与目前1200-2420 USD/吨的市场售价在商业上一较高下。
当然,这项研究距离真正的工业化还有几道坎要过:
1.辅酶再生的"经济账"仍是最大短板。目前依赖化学法(六偏磷酸钠)进行ATP再生,占据了总成本的最大板块。未来亟需开发基于光驱动或电驱动的低成本辅酶再生系统,才能从根本上提升经济可行性。
2. 酶的工程寿命。体外多酶体系中的酶无法像活细胞那样自我修复和更新。需要通过固定化酶技术提升AAS及整个级联酶系的半衰期和重复使用批次。
3. 体内-体外双轨并行。文章特别提到,若通过进一步蛋白质工程(如突变体AAS-D301S)消除副产物生成能力,并结合高耐受底盘细胞的改造,未来该通路有潜力被重新植入工业微生物中——实现"体内+体外"双轨并行的制造蓝图。
来源:https://doi.org/10.1038/s41467-026-75484-w
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